L’Etat-major interministériel de zone sud est composé d’une trentaine d’agents issus de différents corps et ministères :
- Sapeurs-pompiers professionnels ;
- Cadres et agents issus des préfectures ;
- Militaires des FORmations Militaires de la Sécurité Civile (FORMISC) ;
- Cadres des ministères de l’économie, de la santé et du développement durable ;
- Officier de gendarmerie ;
- Cadres de la Police nationale.

L'effectif nominal de l'EMIZ est appelé à animer le centre opérationnel de zone, il peut être renforcé en cas d’événements graves, par la participation de personnels appartenant aux services déconcentrés de l’Etat et des grands opérateurs de service public de niveau supra-départemental (EDF, télécom. etc.). Pendant la « campagne feux-de-forêts », de juin à septembre, l’EMIZ est systématiquement renforcé par la présence permanente de prévisionnistes de Météo-France, d’un officier de liaison des FORMISC, d’un officier de l’Etat-major interarmées de la zone de défense et d'une cellule des opérations aériennes de la sécurité civile animée par des officiers et sous officiers de l’armée de l’air.

En dehors de la période feux de forêts (mise à disposition du Préfet de zone de moyens nationaux), l'état-major interministériel de zone ne dispose pas de moyens d'intervention propres, il recherche et attribue les moyens de secours relevant de l'État, des collectivités locales et de leurs établissements publics et peut réquisitionner des moyens privés le cas échéant.

Dans l’attente d’un prochain déménagement vers Marseille, afin d’être au plus près du Préfet de zone, l’EMIZ est installé, depuis sa création en 1979, sur le site de Valabre, à 8 kms au sud d’Aix-en-Provence.
Il dispose d’une antenne opérationnelle en Corse, le Centre de Coordination Avancée de la Sécurité Civile (CCASC), située sur l’aéroport d’Ajaccio, qui n’est activée que pendant la période des feux de forêts.
Pour mener à bien ses missions, l’Etat-major interministériel de zone dispose de moyens de communication :
- Radios, lui permettant d’être en contact permanent avec les aéronefs de la sécurité civile, hélicoptères ou avions bombardiers d’eau ;
- Téléphoniques (fixes, mobiles et réseaux interministériels) ;
- Vidéo (visioconférence)
- Informatiques, qu’il s’agisse des messageries internes du ministère de l’intérieur, de l’utilisation des réseaux internet, ou d’applications spécifiques telles que SYNERGI (partage, au niveau national, des informations relatives à un événement), ou du système d’information géographique (SIG) permettant de produire des plans et des cartes adaptés à chaque situation opérationnelle.